分析機器紹介

Genetic analysis遺伝子解析

リアルタイムPCR装置

メーカー
Roche Diagnostics K.K.
機種名
LightCycler 480Ⅱ
機器仕様
  • シングルまたはマルチカラー測定が可能
  • 96または384 well Plate対応
測定用途
  • 遺伝子解析
  • 遺伝子の定量(遺伝子検出、絶対定量、相対定量、遺伝子発現解析)
  • 遺伝子変異解析(加水分解プローブを用いたジェノタイピング)
  • 多重プレート解析(96または384*well Plate)*384 well PlateはLight Cycler480 IIのみ対応
  • 薬効薬理試験
  • 薬物動態試験

LightCycler 480IIは、実績のある高性能なリアルタイムPCR装置です。シングルまたはマルチカラーに対応した汎用性の高いプレートベースの測定機器です。メディフォードでは、LightCycler 480IIの他に、Thermo Fisher Scientific社製QuantStudio 7Pro、7500 Fast Dx Real-Time PCR instrumentも保有しています。

Gene Titan MCシステム

メーカー
Thermo Fisher Scientific K.K.
機種名
GeneTitan Multi-Channel Instrument System
機器仕様
  • ハイブリダイゼーション、洗浄、画像処理を1台に統合したマイクロアレイ自動処理システム
  • 遺伝子発現解析では最大96サンプル、ジェノタイピングでは最大384サンプルを一度に処理可能
測定用途
  • 遺伝子解析
  • 遺伝子発現解析(全トランスクリプトーム解析、遺伝子発現プロファイリング、ゲノムワイドmiRNAおよび短縮ノンコーディングRNA解析)
  • ジェノタイピング(ゲノムワイド関連解析、ターゲットジェノタイピング、集団遺伝子調査、バイオバンク研究)
  • ファーマコゲノミクス

アレイPlate専用のマイクロアレイ自動処理装置です。自動化により操作間バイアスを軽減し、高品質なデータを提供します。 複数のアレイPlateフォーマットにより遺伝子発現解析およびジェノタイピングが可能です。全トランスクリプトーム解析、遺伝子発現プロファイリング、ゲノムワイド関連解析(GWAS)、ファーマコゲノミクスなど幅広い用途に対応可能です。

次世代シーケンサー

メーカー
Illumina, Inc
機種名
NextSeq 2000
機器仕様
  • Sequence by Synthesis(SBS)テクノロジーを用いた実績あるベンチトップシーケンサー
測定用途
  • 遺伝子解析
  • 小規模全ゲノムシーケンス
  • トータルRNA-Seq
  • mRNA-Seq
  • 16S RNAシーケンス

パターン化フローセル技術により多様なシーケンスアプリケーションでの測定が可能です。カートリッジとフローセルの組み合わせにより、40~330 Gbの出力、1ラン当り4億~11億リードのデータが得られます。UDIを使用することで最大384サンプルの測定に対応できます。

GeneChip System

メーカー
Thermo Fisher Scientific K.K.
機種名
GCS3000Dx v.2 System
機器仕様
  • 一度に最大48枚のカートリッジアレイを測定可能
  • 高解像度にスキャンが可能
測定用途
  • 遺伝子解析
  • 遺伝子発現解析
  • ジェノタイピング
  • miRNA解析

アレイタイプに応じて0.51~2.5μmの高解像度でスキャンが可能な機器です。最大48アレイの測定が可能です。Applied Biosystem独自の Flying Objectiveレンズテクノロジーにより、スキャンエリア全体にわたる最適な画像の均一性と収集効率が特徴です。弊社はアフィメトリクス社認定の受託サービスプロバイダーです。

DNA Microarray Scanner

メーカー
Agilent Technologies
機種名
G2505CA
機器仕様
  • 5桁の広いダイナミックレンジ
  • マルチアレイフォーマットに対応可能
測定用途
  • 遺伝子解析
  • 遺伝子発現解析(バイオマーカーの探索、Toxicogenomics研究)
  • CGH解析(コピー数異常のプロファイリング)
  • miRNA解析(疾患とmiRNAの関連解析)

Sure Print技術で高品質なスライド型アレイを高感度に測定できる機器です。ダイナミックレンジは5桁。マルチアレイフォーマットに対応できるため低コストに測定が可能です。カタログアレイ、カスタマイズにも対応可能です。

nCounter System

メーカー
NanoString Technologies, Inc.
機種名
nCounter Analysis System
機器仕様
  • NanoString Technologies 社が開発した蛍光分子バーコードを持つプローブにより、ターゲット配列のパターンをデジタル検出します
測定用途
  • 遺伝子解析
  • RNA発現解析(微量RNA、lncRNA、Fusion Gene、miRNA)
  • DNA解析(SNV、コピーナンバー)
  • タンパク質発現解析

PCR増幅不要のデジタルカウントで、FFPE由来のクルードなサンプルにも対応可能です。ハイブリダイゼーション後の精製・カートリッジ作成は自動化され、人為的なバイアスを抑制します。カタログパネル、カスタムパネルに加え、96サンプル×96遺伝子のMultiplex解析やタンパク質発現解析にも対応可能です。最大800遺伝子を同時測定できるため、低コストでの測定が実現できます。

キャピラリシーケンサー

メーカー
Thermo Fisher Scientific K.K.
機種名
3500xL
機器仕様
  • 24本キャピラリーシステムにより、ハイスループットの測定に対応
測定用途
  • 遺伝子解析
  • DNAシーケンシング
  • アライメント解析
  • フラグメント解析

サンガーシーケンス法を用いてDNAの塩基配列を決定する装置です。一度の測定で96 well Plateを同時に2枚分析でき、最大で192サンプルの測定が可能です。また、DNAフラグメント解析にも対応しています。 消耗品は自家調製不要、消耗品自動管理機能により安定的なデータ取得が可能です。